Usługa sekwencjonowania NGS (ang. Next Generation Sequencing)

Description

Wykonanie usługi sekwencjonowania NGS (ang. Next Generation Sequencing) dla prób dostarczonych w partiach złożonych od 1 do 200 próbek. Usługa wykonana zostanie na podstawie materiału - całkowitego DNA dostarczonego przez Zamawiającego. Parametry DNA: • całkowita ilość ≥ 1ug (5ug Nanopore) • stężenie w próbce >100 ng/ul • czystość (A260/A280) ≥ 1.8 Lot 1: 1. Zamawiający zleca wykonanie usługi wielorazowej (w transzach) 2. Wykonanie usługi sekwencjonowania NGS (ang. Next Generation Sequencing) dla prób dostarczonych w partiach złożonych od 1 do 200 próbek. 3. Usługa wykonana zostanie na podstawie materiału - całkowitego DNA dostarczonego przez Zamawiającego. Parametry DNA: • całkowita ilość ≥ 1ug (5ug Nanopore) • stężenie w próbce >100 ng/ul • czystość (A260/A280) ≥ 1.8 Sekwencjonowanie NGS DNA genomu bakteryjnego o wielkości 2-3 mln par zasad z użyciem platformy Illumina MiSeq; odczyty sparowane o długości 250 zasad; pokrycie 50x; adapter & quality trimming oraz składanie genomów – 650 prób Sekwencjonowanie NGS DNA genomu bakteryjnego o wielkości 5-6 mln par zasad z użyciem platformy Illumina MiSeq; odczyty sparowane o długości 250 zasad; pokrycie 50x; adapter & quality trimming oraz składanie genomów – 1100 prób Sekwencjonowanie NGS DNA genomu bakteryjnego o wielkości 2-6 mln par zasad z użyciem platformy Nanopore Minion; pokrycie 50x; adapter & quality trimming oraz składanie genomów z wynikami Miseq – 100 prób Zamawiający przewiduje zastosowanie procedury, o której mowa w art. 139 ustawy Pzp. Szczegółowe informacje w rozdz. III SWZ