SERVICIO WES/WGS/RNAseq ONCOPED

Description

El objeto del presente procedimiento de licitación es la contratación del servicio de secuenciación avanzada (con y sin análisis bioinformático) mediante las siguientes técnicas genómicas: Whole Genome Sequencing (WGS), Whole Exome Sequencing (WES) y RNA sequencing (RNAseq) destinado al grupo de investigación “Childhood Cancer and Blood Disorders” de la Fundació Hospital Universitari Vall Hebron - Institut de Recerca (VHIR), según lo que se estipula en el presente Pliego de Prescripciones Técnicas. Lot 1: Servicio de secuenciación avanzada (con y sin análisis bioinformático) mediante las siguientes técnicas genómicas: Whole Genome Sequencing (WGS), Whole Exome Sequencing (WES) y RNA sequencing (RNAseq): El número estimado de muestras que se estudiarán dentro los 4 proyectos son: 1. Estudio de muestras de 130 pacientes a los que se les realizará WES del ADNg de la sangre, WES del ADNg del tumor y RNAseq del ARN del tumor. Dentro de los proyectos de medicina personalizada SEHOP-PENCIL, COMIKv2.0 y COMIK. 2. Estudio de muestras de 20 pacientes a los que se les realizará WGS del ADNg de la sangre o WGS del ADNg de la sangre y del tumor. Dentro de los proyectos de medicina personalizada SEHOP-PENCIL y COMIK. 3. Estudio de 45 modelos animales (PDX) a los que se les realizará WES del ADNg del tumor y RNAseq del ARN del tumor. Dentro de los proyectos de medicina personalizada COMIKv2.0 y COMIK. 4. Estudio de 45 pacientes a los que se les realizará WES del ADNg de la sangre, WES del ADNg del tumor y RNAseq del ARN del tumor o WGS del ADNg de la sangre, WGS del ADNg del tumor y RNAseq del ARN del tumor. Dentro del proyecto del ensayo clínico ABTL0812. 5. Estudio de 25 modelos animales inmunocompetentes a los que se les realizará RNA seq de las muestras. Dentro del proyecto del ensayo clínico ABTL0812.