Laboratory, optical and precision equipments (excl. glasses)

Description

Le présent marché a pour objet l’acquisition, la livraison, l’installation, la mise en service, la garantie et la maintenance préventive et curative d’un scanner de lames ultra haut débit pour imagerie histologie lumière transmise par la structure Inserm UMR1037 Centre de recherches en cancérologie de Toulouse (CRCT). Afin de mieux comprendre les interactions cellulaires au niveau du micro-environnement tumoral in situ et dans le cadre du développement de nouvelles techniques d’analyse des images histologiques mettant en jeu des algorithmes d’intelligence artificielle (deep-learning), le Centre de recherches en cancérologie de Toulouse (CRCT) souhaite se doter d’un scanner de lames histologiques pour l’imagerie de tissus entiers ultra haut débit afin de constituer des collections et bases de données nécessaire à l’entrainement de réseaux de neurones artificiels. L’équipement scanner de lames devra à la fois permettre l’obtention d’images de haute résolution à relativement faible grossissement (20X) et être compatible avec une utilisation ultra haut débit et proposer un workflow d’acquisition d’images complètement automatisé afin de réduire au maximum l’intervention humaine. Les spécifications techniques attendues par la plate-forme de recherche pour le scanner sont: — illumination LED; — objectifs à forte NA; — faible encombrement (1 m3 maximum); — technologies avancées d’acquisition d’images en lumière transmise: contrôle dynamique du focus et contrôle qualité automatisé en temps réel; — vitesse d’acquisition: 35-40 secondes pour un tissu de 15 × 15 mm (40X, minimum de 70 lames/heure); — résolution minimum: 0.26 μm/pixel; — format d’image: DICOM-WSI + Tiled-TIFF + autres; — format d’image compatible en natif avec les SGI Tribvn Calopix et Cytomine; — format d’image compatible en natif avec les APIs OpenSlide et OpenMicroscopy (BioFormats); — chargement continu avec gestion des priorités; — chargement compatible avec les portoirs de lames des marques SAKURA et LEICA (automates de coloration et d’immunohistochimie); — lecture de codes-barres (1D/2D/QRcode/Datamatrix); — IHM tactile de pilotage de l’automate, et liaison directe au réseau interne de l’institut (pas de poste informatique attaché); — gestion et paramétrage côté serveur et évolutive (possibilité de gérer plusieurs scanner avec un seul serveur); — support de proximité en France. Une garantie et des prestations de maintenance préventive et curative de l'équipement est demandé pour une durée de cinq ans.