SERVICES D'EXTRACTION D'ADN ET DE SÉQUENÇAGE CIBLÉ DE CINQ ESPÈCES DE PALMIERS D'AMAZONIE POUR LE PROJET ERC DOPAMICS

Description

Le projet ERC 'DOPAMICS' étudie les processus d'adaptation et de domestication de cinq espèces de palmiers d'Amazonie (famille : Arecaceae ; sous-famille : Arecoideae) dans les paysages forestiers de Guyane française. Le présent marché a pour objet, d'une part, l'extraction et le traitement de l'ADN génomique et, d'autre part, la réalisation de l'expérimentation de capture et le séquençage à haut débit d'un minimum de 1500 spécimens de palmiers d'Amazonie. Lot 1: Le présent marché (Lot 1) a pour objet l'extraction de l'ADN génomique d'un minimum de 1500 spécimens de palmiers d'Amazonie à partir d'échantillons de feuilles, comprenant : - Extraction de l'ADN total, traitement RNAse A et Protéinase K, purification(s) éventuelle(s),- Dosage et contrôle qualité des ADNs génomiques extraits,- Expédition des ADNs génomiques extraits au titulaire du Lot 2 du marché (si différent du Titulaire du Lot 1).Les prestations et leurs modalités d'exécution sont décrites dans le CCAP et le CCTP du lot 1. Durée : 24 mois à compter de la notification du marché.Accord-cadre à bons de commande avec un seul opérateur économique avec, pour toute la durée du marché, un minimum (= Extraction de l'ADN génomique à partir de 1 500 échantillons de feuilles) et un maximum (= 20 000 EUR HT).Forme des prix : prix unitaires. Lot 2: Le présent marché (Lot 2) a pour objet la réalisation de l'expérimentation de capture et le séquençage à haut débit d'un minimum de 1500 spécimens de palmiers d'Amazonie, comprenant : - Préparation des librairies individuelles,- Enrichissement ciblé par hybridation de sondes de capture avec un kit de capture sur mesure (technologie ' myBAITS® Custom DNA-Seq' (Daicel Arbor Bioscience),- Séquençage à haut débit des librairies,- Contrôle qualité des données de séquençage.L'objectif de ce lot sera d'obtenir les données de séquençage avec une couverture de séquençage sur cible de 10X minimum par librairie.Les prestations et leurs modalités d'exécution sont décrites dans le CCAP et le CCTP du lot 2. Durée de l'accord-cadre : 24 mois à compter de la notification du marché.Accord-cadre à bons de commande avec un seul opérateur économique avec, pour toute la durée du marché, un minimum (= préparation des librairies, enrichissement ciblé par hybridation de sondes de capture et séquençage de 1 500 échantillons) et un maximum (= 190 000 EUR HT).Forme des prix : prix unitaires.